Ook in de uitvoeringsfase is een sterke structuur nodig: het projectteam zet alles in het werk om de werken zo efficiënt mogelijk te laten verlopen. De procesnota wordt geactualiseerd, net zoals de financiële afspraken.
Nu de nodige werken in kader van het project gekend zijn, kan een bestek opgemaakt worden om de werken uit te voeren. Na het doorlopen van de aanbestedingsprocedure wordt een aannemer aangesteld om de werken uit te voeren.
Het project wordt uitgevoerd, de werken op het terrein vatten aan.
Samen met de uitvoering van het project worden een ganse reeks andere maatregelen goedgekeurd of gerealiseerd. Het is van belang in de processtructuur voldoende aandacht te hebben voor een tijdige uitvoering van de maatregelen uit het actieprogramma.
Eenmaal een project gerealiseerd, is het belangrijk om te waken over de kwaliteit. Daarom wordt een beheerplan opgemaakt met een inventaris van taken en verantwoordelijkheden, inclusief de nodige engagementen (financieel, personeel).
Eens het project gerealiseerd, gebeurt een evaluatie. Beantwoordt het project aan de oorspronkelijke doelstellingen? Doen de voorspelde effecten zich voor? In welke mate? Het projectbesluit bevat doorgaans een aantal clausules om extra maatregelen op te nemen indien bepaalde effecten zich meer of minder zouden manifesteren. Het is aan de bevoegde overheid die het projectbesluit heeft genomen, om eventuele extra acties in gang te zetten.
